Cụ thể, 4 trạm chưa thu phí, trong đó có 2 trạm do “đầu tư một nơi thu phí một nơi” là Trạm La Sơn – Túy Loan trên tuyến cao tốc Bắc – Nam đoạn La Sơn – Túy Loan, Bỉm Sơn. Ga trên đường cao tốc Bắc Nam. Quốc lộ 1, không đáp ứng Nghị quyết số 437? NQ-UBTVQH14 ngày 21/10/2017 của Ủy ban Thường vụ Quốc hội; Hai trạm có vấn đề về an ninh trật tự khi tổ chức thu phí là Trạm Bờ Đậu trên Quốc lộ 3 và Trạm T2 trên Quốc lộ 91.
Ngoài ra, 4 dự án đã triển khai thu phí nhưng không đảm bảo phương án tài chính ban đầu. Trong đó, có 3 dự án giảm thu là: Dự án nâng cấp, mở rộng đường Hồ Chí Minh Km1738 + 144 – Km1763 + 610; Dự án đầu tư xây dựng cầu Thái Hà; Dự án đầu tư xây dựng cầu Việt Trì – Ba Vì nối Quốc lộ 32C. Còn một dự án khác do điều chỉnh quy hoạch cảng thủy nội địa nên không tổ chức thu phí.
Để giải quyết dứt điểm vướng mắc của các trạm thu phí / dự án BOT, Bộ GTVT đã kiến nghị Chính phủ trình Quốc hội xem xét, quyết định giải pháp chấm dứt hợp đồng trước thời hạn và bố trí ngân sách. khoảng 13.115 tỷ đồng để nhà nước thanh toán cho chủ đầu tư dự án.
Liên quan đến vấn đề này, trong văn bản lấy ý kiến về giải pháp xử lý các tồn tại, bất cập tại một số trạm thu phí / dự án đầu tư hạ tầng theo hình thức BOT, Bộ Kế hoạch và Đầu tư cho rằng: Cả 8 dự án vướng mắc đều triển khai trước thời điểm có hiệu lực. Luật PPP, do đó, từng dự án cần được xem xét, định lượng trên cơ sở nội dung của hợp đồng BOT đã ký liên quan đến luật PPP. các trường hợp, điều kiện áp dụng, quyền và nghĩa vụ, trách nhiệm của các bên khi chấm dứt hợp đồng sớm và quy định của pháp luật có liên quan về vấn đề này.
Bộ Kế hoạch và Đầu tư đề nghị Bộ Giao thông vận tải trao đổi với Bộ Tư pháp để xác định tính phù hợp của việc áp dụng sự kiện bất khả kháng đối với dự án yêu cầu chấm dứt hợp đồng này, trên cơ sở căn cứ theo quy định của pháp luật dân sự và nội dung hợp đồng.
Ngoài ra, cần phân loại cụ thể 8 dự án theo 2 trường hợp chấm dứt hợp đồng gồm: do sự kiện bất khả kháng và do cơ quan ký hợp đồng vi phạm hợp đồng để làm cơ sở xác định phương án thanh toán. phí xử lý phù hợp với từng trường hợp (có chính sách hỗ trợ cụ thể cho từng dự án).
Theo Bộ GTVT, trong giai đoạn 2005-2020, Bộ GTVT đã huy động được khoảng 247.575 tỷ đồng đầu tư vào 72 dự án theo phương thức PPP.
